Vrouwen die zwanger zijn en kampen met epilepsie, moeten het middel topiramaat niet gebruiken voor hun aandoening. Dat adviseren het Europees Geneesmiddelenbureau (EMA) en het College ter Beoordeling van Geneesmiddelen (CBG) in Nederland, die toezicht houden op geneesmiddelen en vaccins.
Topiramaat kan schadelijk zijn voor ongeboren kinderen. Zo kan het leiden tot stoornissen bij de ontwikkeling van de hersenen. Het middel wordt ook voorgeschreven aan mensen die last hebben van migraine. Zij hadden eerder al het advies gekregen om het middel niet te nemen als ze zwanger zijn.